Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00467Q9BRT7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms