Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MXRA8Q9BRK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXRA8Q9BRK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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