Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms