Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms