Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms