Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms