Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDX2Q99626 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDX2Q99626 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms