Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms