Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms