Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP5Q96RT8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms