Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms