Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms