Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMTK3Q96Q04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms