Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGAP1Q96PV0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms