Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms