Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms