Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK3Q96L96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms