Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDHR1Q96JP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms