Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA7LQ96GN5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms