Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
L3HYPDHQ96EM0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms