Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms