Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms