Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms