Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms