Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms