Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRQ92752 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRQ92752 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRQ92752 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRQ92752 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRQ92752 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRQ92752 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNRQ92752 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TNRQ92752 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRQ92752 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRQ92752 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRQ92752 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRQ92752 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRQ92752 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRQ92752 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRQ92752 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRQ92752 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRQ92752 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRQ92752 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRQ92752 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRQ92752 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRQ92752 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRQ92752 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRQ92752 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNRQ92752 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNRQ92752 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
TNRQ92752 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRQ92752 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNRQ92752 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRQ92752 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRQ92752 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms