Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NCSTNQ92542 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms