Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX1Q92499 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms