Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms