Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4DQ8WXI8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4DQ8WXI8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms