Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG3Q8WXD2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms