Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS9Q8WXC6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS9Q8WXC6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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COPS9Q8WXC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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COPS9Q8WXC6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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