Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKA2Q8WVK7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms