Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms