Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms