Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC24Q8N4L8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC24Q8N4L8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms