Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBARPQ8N350 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBARPQ8N350 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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