Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPICE1Q8N0Z3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPICE1Q8N0Z3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms