Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC103Q8IW40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC103Q8IW40 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms