Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 770.7 ms