Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNL1Q8IU54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms