Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms