Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PBRM1Q86U86 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PBRM1Q86U86 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms