Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms