Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms