Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2BQ7L1I2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms