Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY3Q7L099 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms