Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms