Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A4Q6YBV0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC36A4Q6YBV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A4Q6YBV0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms