Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms